ความยุติธรรมทางอาญาจำเป็นต้องมีลำดับชั้นในระบบตุลาการขึ้นอยู่กับความรุนแรงของข้อหา อาชญากรที่ชั่วร้ายที่สุดอาจถูกตัดสินโดยฟาโรห์เท่านั้น บ่อยครั้งที่ท่านราชมนตรีดำเนินการสอบสวนและหันไปหาฟาโรห์เพื่อตัดสินขั้นสุดท้าย ในบางกรณี ฟาโรห์ ได้แต่งตั้งคณะกรรมการพิเศษที่มีอำนาจเต็มที่ในการตัดสิน การลงโทษสำหรับอาชญากรรมร้ายแรงรวมถึงการจำยอมและการประหารชีวิต การทำร้ายและการเฆี่ยนมักใช้เพื่อลงโทษผู้กระทำความผิดที่น้อยกว่า